Yo compré una alarma yankee y lo de las ventanas lo hago con un modulo espcifico pa subir y bajar ventas, vamos q no tiene nada q ver con la alarma.
La alarma tiene unas salidas auxiliares q mandan una señal cuando cierras el coche. La salida de la alarma que manda esa señal la conecto al modulo y el modulo de cierre de ventanas al recibir dicha señal las cierra. En el modulo tengo conectado la señal auxiliar y los cables de los botones de subir y bajar ventanas.
Quizas te sirva echarle un vbistazo a este post (sino siempre puedes abrir uno, alli hay gente q controla de este tema):
http://www.saxperience.com/forum/showthread.php?t=82295